Gimnazijos istorija rašoma nuo tada, kai šalia Oko miško, buvusio Tauragės pakraštyje, Žalgirių mikrorajone 1972 m. kovo 3 dieną duris atvėrė Tauragės 4-oji vidurinė mokykla: 1172 moksleiviai ir 39 mokytojai. Mokyklai ėmėsi vadovauti direktorė Leokadija Judelienė. Buvo subrandintos ir įkurtos sustiprinto piešimo mokymo klasės. Mokyklos vestibiulyje esantis Žalgirio mūšio pano buvo parsigabentas iš Vilniaus dailės instituto ir simbolizuoja išsaugotą mūsų tautinę dvasią.1987 metų rugsėjį mokyklos vairą perėmė Arimantas Šerlinskis, buvęs direktoriaus pavaduotojas ugdymui. Mokykla turėjo 1438 mokinius, o juos mokė 66 mokytojai. Atkūrus šalies nepriklausomybę ir mokyklos bendruomenei pageidaujant 1996 metais mokykla pavadinta Žalgirių vidurine mokykla. Ypatingas dėmesys buvo skirtas profiliuoto ugdymo modeliui įgyvendinti ir mokyklos renovacijai, kuri Lietuvos valstybės ir Europos Sąjungos fondų lėšomis buvo baigta 2007 metais.Nuo 2008–2009 mokslo metų pradžios mokyklai vadovavo direktorė Viktorija Paulauskienė. Mokykloje mokėsi 953 mokiniai ir dirbo 71 mokytojas. Pagrindiniu darbotvarkės klausimu buvo vidurinio ugdymo programos akreditacija ir vidurinės mokyklos pertvarkymas į gimnaziją, kuris pradėtas įgyvendinti 2009 metais. 2016 metų kovo 10 dieną Žalgirių gimnazijos direktoriumi paskirtas Jonas Jatautas. 2019 m. rugsėjo 1 d. gimnazijoje mokslo metus pradėjo 459 mokiniai. Gimnazija kuria savitą individualizuoto (personalizuoto) ugdymo modelį, kurio esminiai bruožai 90 (45+45) min. pamoka ir mokinių veiklinimas taikant individualiai karjerai daugiau ar mažiau svarbių metinių projektų metodą. 2023 metų sausio 10 dieną gimnazija atvertė naują savo istorijos puslapį – gimnazijai vadovauti pradėjo Elmyra Jurkšaitienė, aktyvi, veikli pedagogė, turinti nemažą vadybinę patirtį. Naujoji vadovė buvo nuoširdžiai sutikta 441 gimnazijos mokinio ir 39 mokytojų.